Kanser Enformatiğinde Tekrarlanabilirliğe Giriş

Bu kurs, biyomedikal bilimler alanındaki öğrenciler ile araştırmalarında enformatik araçları kullanan ancak tekrarlanabilirlik araçları ve yöntemleri konusunda eğitim almamış araştırmacılara yöneliktir. Bu kurs, şu özelliklere sahip bireyler için yazılmıştır: - R veya Python dillerine biraz aşina olan ve bazı betikler (script) yazmış olanlar. - Hesaplamalı yöntemler konusunda resmi bir eğitim almamış olanlar. - GitHub, Docker veya paket yönetim araçları hakkında sınırlı bilgiye sahip olan veya hiç bilgisi olmayanlar. Motivasyon: Veri analizleri, orijinal araştırmacılarla doğrudan iletişim kurulmadan ve önemli miktarda zaman ve çaba harcanmadan genellikle tekrarlanamaz (BeaulieuJones ve ark., 2017). Kanser enformatiğinde (diğer alanlarda olduğu gibi) tekrarlanabilirlik, bilimsel yöntemin temelini oluşturmasına rağmen henüz denetlenmemekte veya teşvik edilmemektedir. Teşvik eksikliğine rağmen birçok araştırmacı kendi çalışmalarında tekrarlanabilirliği sağlamak için çabalamakta, ancak bunu etkili bir şekilde yapacak beceri veya eğitimden yoksun olmaktadır. Araştırmacıları tekrarlanabilir veri analizleri oluşturma becerileriyle donatmak, sürece dahil olan herkesin verimliliğini artırır. Tekrarlanabilir analizlerin başkaları tarafından anlaşılması, uygulanması ve kopyalanması daha olasıdır. Bu da bilimsel süreci hızlandırmaya yardımcı olur...