Bitki Biyoenformatiği Bitirme Projesi

Son 15 yıl bitki biyolojisinde heyecan verici gelişmelerle dolu geçti. Yüzlerce bitki genomu dizilendi, RNA-seq transkriptom genelinde ifade profili oluşturulmasını sağladı ve "-seq" tabanlı yöntemlerin yaygınlaşması, protein-protein ve protein-DNA etkileşimlerinin ucuza ve yüksek verimli bir şekilde belirlenmesine olanak tanıdı. Bu veri setleri de bir fare tıklaması veya parmak dokunuşuyla hipotezler üretmemizi sağlıyor. Coursera.org'daki Bitki Biyoenformatiği kursunda, genom tarayıcılarından transkriptomik veri madenciliğine, promotör/ağ analizlerine kadar bitkiye özgü 33 çevrimiçi aracı ele aldık. Bu Bitki Biyoenformatiği Bitirme Projesinde ise, işlevi bilinmeyen bir gen için biyolojik bir rol hipotezi kurmak amacıyla bu araçları kullanacak ve bunu yazılı bir laboratuvar raporunda özetleyeceğiz. Bu kurs, temel biyoenformatik yetkinliklerini ve kaynaklarını (NCBI'ın Genbank'ı, Blast, çoklu dizi hizalamaları, Biyoenformatik Yöntemleri I'deki filogenetik, ardından Biyoenformatik Yöntemleri II'deki protein-protein etkileşimleri, yapısal biyoenformatik ve RNA-seq analizi gibi) tanıtan Coursera'daki Bitki Biyoenformatiği Uzmanlık programının bir parçasıdır.